Delo na drugi generaciji Fiat Ducato se je začelo že leta 1987. Za oblikovanje karoserije je bil odgovoren Giorgetto Giugiaro iz podjetja Ital Design. Novi Ducato naj bi bil po zaslugi optimalnega (takrat) zmanjšanja zračnega upora preboj na področju aerodinamike gospodarskih vozil. Racionaliziran sprednji del druge generacije Ducato je prispeval k rezultatu Cx = 0,35, kar je bil najboljši rezultat med evropskimi kombiji v tistem času. Po preteku časa je bil stari slog popolnoma opuščen. Notranje, delovno poimenovanje novega vozila je bil izraz Type 230.
Ducato druge generacije je bil prvič predstavljen marca 1994 na ženevskem sejmu. Leto pozneje je italijanski kombi osvojil prvo mesto na prestižnem tekmovanju Van Of The Year. Ohranjenih je bilo nekaj oblikovnih rešitev, ki so delovale v prejšnji generaciji. Odločili so se za pogon na sprednja kolesa in motor nameščali prečno. Sprednje vzmetenje temelji na McPhersonsu, zadnje pa ima togo os na paraboličnih vzmeti. Poudarek pa je bil na ustvarjanju številnih različic karoserije z različnimi dolžinami, višino in malo vrstami medosnih koles. Namesto da bi razvili Fiat Tolento, so se preprosto odločili za izdelavo manjše, bolj kompaktne različice Ducato II z dolžino 4521-5681 mm in medosno razdaljo 2850-3700 mm. Fiat Ducato II naj bi bil modernejši, aerodinamični in prilagojen potrebam najširšega kroga kupcev. Najpogostejše so bile različice z 1.9D dizelskimi motorji. Na začetku je bila na voljo le ena različica bencinskega motorja z 109 KM. Septembra 2000 se je v Sete Lagoas v Braziliji začela proizvodnja Fiat Ducato II.
Leta 2002 je bil Fiat Ducato posodobljen. Poleg dviga karoserije so spremenili tudi notranjost vozila in ponudbo motorjev, ki so na voljo. To je bila tudi prva različica Ducato, ki je bila na voljo s pogonom 4x4 v tovarniški različici. Poleg tega je bila razvita paleta bencinskih motorjev. Še vedno so bile dvolitrske enote, vendar so bile predstavljene različice, ki jih poganja CNG (97 KM) in LPG (109 KM). Notranja oznaka prenovljenega kombija je bila Type 244. Spremembe so bile tako velike, da je marsikdo osveženo različico ocenil kot popolnoma novo generacijo Fiatovega kombija. Najpomembnejši elementi vozila, na primer tekalna oprema, so prišli iz vrste 230. Toda te spremembe veljajo le za dvig obraza. Vse dizelske enote, ki so poganjale Ducato II, so bile opremljene z injekcijo Common Rail. To vpliva na stopnjo zmanjšanja izgorevanja in povečanje moči motorja. Najmočnejša enota je ustvarila 146 KM. 15. decembra 2005 je podjetje sporočilo, da je proizveden 3-milijonski Fiat Ducato. Ta rezultat je prispeval k povečanju proizvodnje na 9 vozil na dan. Vredno je omeniti, da je različica Ducato II, ki se ukvarja s sprednjim dvigom, v Braziliji imela tako priljubljenost, da se je proizvajala do leta 2018. To je bilo mogoče, ker v Južni Ameriki ni bilo omejitev glede emisij.
